Elektrood-03-npt: Difference between revisions

From Intelligent Materials and Systems Lab

mNo edit summary
mNo edit summary
Line 35: Line 35:
RDF graafikud.
RDF graafikud.
Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
RDF graafikud.
Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
B-C8 (anioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C8.png|320px]]
F-F8 (anioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-F8.png|320px]]
B-C (anioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C.png|320px]]
F-C (anioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-C.png|320px]]
B-N (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-NA.png|320px]]
F-H1 (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-H1.png|320px]]
C8-C (Teflon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C8-C.png|320px]]
F8-C (Teflon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F8-C.png|320px]]
H1-C (katioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-H1-C.png|320px]]
N-C (katioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C.png|320px]]
H1-F8 (katioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-H1-F8.png|320px]]
N-C8 (katioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C8.png|320px]]
C-C (grafiit-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C-C.png|320px]]
C8-C8 (Teflon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C8-C8.png|320px]]
B-B (anioon-anioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-B.png|320px]]
N-N (katioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-NA.png|320px]]
N-C1 (katioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C1.png|320px]]
N-CE (katioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-CE.png|320px]]
RDF graafikud simulatsiooni lõpust:
B-CW (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CW.png|320px]]
B-CR (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CR.png|320px]]
B-C1 (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C1.png|320px]]
B-CE (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CE.png|320px]]


B-C8 (anioon-Teflon):
B-C8 (anioon-Teflon):
Line 167: Line 229:
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-volume.png|320px]]
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-volume.png|320px]]


RDF graafikud.
Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
B-C8 (anioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C8.png|320px]]
F-F8 (anioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-F8.png|320px]]
B-C (anioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C.png|320px]]
F-C (anioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-C.png|320px]]
B-N (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-NA.png|320px]]
F-H1 (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-H1.png|320px]]
C8-C (Teflon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C8-C.png|320px]]
F8-C (Teflon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F8-C.png|320px]]
H1-C (katioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-H1-C.png|320px]]
N-C (katioon-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C.png|320px]]
H1-F8 (katioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-H1-F8.png|320px]]
N-C8 (katioon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C8.png|320px]]
C-C (grafiit-grafiit):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C-C.png|320px]]
C8-C8 (Teflon-Teflon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C8-C8.png|320px]]
B-B (anioon-anioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-B.png|320px]]
N-N (katioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-NA.png|320px]]
N-C1 (katioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C1.png|320px]]
N-CE (katioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-CE.png|320px]]
RDF graafikud simulatsiooni lõpust:
B-CW (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CW.png|320px]]
B-CR (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CR.png|320px]]
B-C1 (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C1.png|320px]]
B-CE (anioon-katioon):
[[Image:40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CE.png|320px]]





Revision as of 13:01, 3 May 2009

System Description

3% Polymer (1 chain) % EMI-BF4 (132 ion pairs) % Carbon (57 platelets)

Simulation conditions

NPT Simulation in a 40Å^3 box. No electric field applied. Length: 10ns.

Simulation statistics

koguenergia: 40A-57C-1T-132E-npt-engcns.png Konfiguratsioonienergia: 40A-57C-1T-132E-npt-engcfg.png

Sidemeenergia: 40A-57C-1T-132E-npt-engbnd.png Nurgaenergia: 40A-57C-1T-132E-npt-engang.png

Dihedraalienergia: 40A-57C-1T-132E-npt-engdih.png Coulombi energia: 40A-57C-1T-132E-npt-engcpe.png

Temperatuur: 40A-57C-1T-132E-npt-temp.png Ruumala: 40A-57C-1T-132E-npt-volume.png


RDF

RDF graafikud. Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.

RDF graafikud. Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.

B-C8 (anioon-Teflon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C8.png F-F8 (anioon-Teflon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-F8.png

B-C (anioon-grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C.png F-C (anioon-grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-C.png

B-N (anioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-NA.png F-H1 (anioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F-H1.png

C8-C (Teflon-grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C8-C.png F8-C (Teflon-grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-F8-C.png

H1-C (katioon-grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-H1-C.png N-C (katioon-grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C.png

H1-F8 (katioon-Teflon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-H1-F8.png N-C8 (katioon-Teflon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C8.png

C-C (grafiit-grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C-C.png C8-C8 (Teflon-Teflon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-C8-C8.png

B-B (anioon-anioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-B.png N-N (katioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-NA.png

N-C1 (katioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-C1.png N-CE (katioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-NA-CE.png

RDF graafikud simulatsiooni lõpust:

B-CW (anioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CW.png B-CR (anioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CR.png

B-C1 (anioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-C1.png B-CE (anioon-katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-RDF-B-CE.png


B-C8 (anioon-Teflon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-C8.png F-F8 (anioon-Teflon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-F-F8.png

B-C (anioon-grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-C.png F-C (anioon-grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-F-C.png

B-N (anioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-NA.png F-H1 (anioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-F-H1.png

C8-C (Teflon-grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-C8-C.png F8-C (Teflon-grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-F8-C.png

H1-C (katioon-grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-H1-C.png N-C (katioon-grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-NA-C.png

H1-F8 (katioon-Teflon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-H1-F8.png N-C8 (katioon-Teflon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-NA-C8.png

C-C (grafiit-grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-C-C.png C8-C8 (Teflon-Teflon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-C8-C8.png

B-B (anioon-anioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-B.png N-N (katioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-NA-NA.png

N-C1 (katioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-NA-C1.png N-CE (katioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-NA-CE.png

RDF graafikud simulatsiooni lõpust:

B-CW (anioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-CW.png B-CR (anioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-CR.png

B-C1 (anioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-C1.png B-CE (anioon-katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-RDF-B-CE.png

Coordination sphere radii

TODO

MSD

MSD:

MSD Arvutamiseks lõikasin HISTORY faili 1ns pikkusteks juppideks ja arvutasin iga jupi MSD eelmistest sõltumatult.

C (grafiit): 40A-57C-1T-132E-npt-MSD-C.png C8 (Teflon): 40A-57C-1T-132E-npt-MSD-C8.png

N (katioon): 40A-57C-1T-132E-npt-MSD-NA.png B (anioon): 40A-57C-1T-132E-npt-MSD-B.png

Diffusion coefficent

TODO

Coordination time evolution plots

Coordination lifetime

Typical clusters

XYZ file

Nurkade jaotus:

C8-C8-C8 (Teflon): 40A-57C-1T-132E-npt-ANG-C8.png C8-C8-C8-C8 dihedraal: 40A-57C-1T-132E-npt-DIH-C8C8.png

CR-NA-C1: 40A-57C-1T-132E-npt-ANG-Nr.png CW-NA-C1: 40A-57C-1T-132E-npt-ANG-Nw.png

NA-C1-CE: 40A-57C-1T-132E-npt-ANG-C1.png CR-NA-C1-CE dihedraal: 40A-57C-1T-132E-npt-DIH-NCd.png

NPT Simulatsioon 40Å boksis 52 lehekesest grafiidist, 2 jupist Teflonist (20 lüli kummaski) ja 132 ioonpaarist EMI+BF4 10 ns jooksul. Teflonit on massi järgi 6%:

koguenergia: 40A-52C-2T-132E-npt-engcns.png Konfiguratsioonienergia: 40A-52C-2T-132E-npt-engcfg.png

Sidemeenergia: 40A-52C-2T-132E-npt-engbnd.png Nurgaenergia: 40A-52C-2T-132E-npt-engang.png

Dihedraalienergia: 40A-52C-2T-132E-npt-engdih.png Coulombi energia: 40A-52C-2T-132E-npt-engcpe.png

Temperatuur: 40A-52C-2T-132E-npt-temp.png Ruumala: 40A-52C-2T-132E-npt-volume.png


MSD:

C (grafiit): 40A-52C-2T-132E-npt-MSD-C.png C8 (Teflon): 40A-52C-2T-132E-npt-MSD-C8.png

N (katioon): 40A-52C-2T-132E-npt-MSD-NA.png B (anioon): 40A-52C-2T-132E-npt-MSD-B.png

Nurkade jaotus:

C8-C8-C8 (Teflon): 40A-52C-2T-132E-npt-ANG-C8.png C8-C8-C8-C8 dihedraal: 40A-52C-2T-132E-npt-DIH-C8C8.png

CR-NA-C1: 40A-52C-2T-132E-npt-ANG-Nr.png CW-NA-C1: 40A-52C-2T-132E-npt-ANG-Nw.png

NA-C1-CE: 40A-52C-2T-132E-npt-ANG-C1.png CR-NA-C1-CE dihedraal: 40A-52C-2T-132E-npt-DIH-NCd.png

Difusioonikoefitsendid

Difusioonikoefitsentide arvutamiseks võtsin kolm viimast ühe nanosekundi pikkust MSD-graafikut ja arvutasin keskmise nende keskmiste sirgete osade tõusudest.

BF4 difusioonikoefitsent (arvutatud booriaatomi järgi):

Koos 3% Tefloniga: D=6.473e-9 cm^2/s

Koos 6% Tefloniga: D=8.306e-9 cm^2/s

EMI difusioonikoefitsent (arvutatud lämmastikuaatomite järgi):

Koos 3% Tefloniga: D=3.250e-8 cm^2/s.

Koos 6% Tefloniga: D=4.793e-8 cm^2/s.

Struktuuri kirjeldus

Ioonvedelik täidavad simulatsiooniboksi servast servani. Ioonvedeliku sees on mõned suured enam-vähem ümmargused gradiidi klastrid. Tefloniahel(ad) on ioonvedeliku sees grafiidist eemal. Kõik EMI-BF ioonid moodustavad ühe suure klastri, paardumata ioone pole.


Ioonide koordineerimise eluiga

Koordinatsiooni ajalise evolutsiooni graafikute arvutamisel loeti NA aatomi (EMI-iooni lämmastikuaatom) ümber koordinatsioonisfääri raadiuseks 5.7Å. Iga graafik kujutab ühe BF4-iooni koordineerumist kõikide EMI-ioonide lämmastikuaatomitega.

Iga viienda BF4-iooni graafikul on selgelt näha lahkumine ühe EMI-iooni juurest ja saabumine uue EMI-iooni juurde ilma hiljem tagasi pöördumata.

Näiteid koordineerimise ajalise käigu graafikutest:

40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-01.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-05.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-09.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-13.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-16.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-17.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-22.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-23.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-28.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-30.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-35.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-40.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-45.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-50.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-55.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-60.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-65.png 40A-57C-1T-132E-npt-evo-BN-70.png

XYZ-failid

File:40A-57C-1T-132E-npt-final.xyz

File:40A-52C-2T-132E-npt-final.xyz