Elektrood-03-npt: Difference between revisions
m (→RDF) |
mNo edit summary |
||
Line 40: | Line 40: | ||
B-C8 (anioon-Teflon): | B-C8 (anioon-Teflon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-C8.png|320px]] | ||
F-F8 (anioon-Teflon): | F-F8 (anioon-Teflon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F-F8.png|320px]] | ||
B-C (anioon-grafiit): | B-C (anioon-grafiit): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-C.png|320px]] | ||
F-C (anioon-grafiit): | F-C (anioon-grafiit): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F-C.png|320px]] | ||
B-N (anioon-katioon): | B-N (anioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-NA.png|320px]] | ||
F-H1 (anioon-katioon): | F-H1 (anioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F-H1.png|320px]] | ||
C8-C (Teflon-grafiit): | C8-C (Teflon-grafiit): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-C8-C.png|320px]] | ||
F8-C (Teflon-grafiit): | F8-C (Teflon-grafiit): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F8-C.png|320px]] | ||
H1-C (katioon-grafiit): | H1-C (katioon-grafiit): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-H1-C.png|320px]] | ||
N-C (katioon-grafiit): | N-C (katioon-grafiit): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-C.png|320px]] | ||
H1-F8 (katioon-Teflon): | H1-F8 (katioon-Teflon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-H1-F8.png|320px]] | ||
N-C8 (katioon-Teflon): | N-C8 (katioon-Teflon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-C8.png|320px]] | ||
C-C (grafiit-grafiit): | C-C (grafiit-grafiit): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-C-C.png|320px]] | ||
C8-C8 (Teflon-Teflon): | C8-C8 (Teflon-Teflon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-C8-C8.png|320px]] | ||
B-B (anioon-anioon): | B-B (anioon-anioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-B.png|320px]] | ||
N-N (katioon-katioon): | N-N (katioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-NA.png|320px]] | ||
N-C1 (katioon-katioon): | N-C1 (katioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-C1.png|320px]] | ||
N-CE (katioon-katioon): | N-CE (katioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-CE.png|320px]] | ||
RDF graafikud simulatsiooni lõpust: | RDF graafikud simulatsiooni lõpust: | ||
B-CW (anioon-katioon): | B-CW (anioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-CW.png|320px]] | ||
B-CR (anioon-katioon): | B-CR (anioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-CR.png|320px]] | ||
B-C1 (anioon-katioon): | B-C1 (anioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-C1.png|320px]] | ||
B-CE (anioon-katioon): | B-CE (anioon-katioon): | ||
[[Image:40A-52C- | [[Image:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-CE.png|320px]] | ||
== Coordination sphere radii == | == Coordination sphere radii == |
Revision as of 12:04, 3 May 2009
System Description
3% Polymer (1 chain) % EMI-BF4 (132 ion pairs) % Carbon (57 platelets)
Simulation conditions
NPT Simulation in a 40Å^3 box. No electric field applied. Length: 10ns.
Simulation statistics
koguenergia: Konfiguratsioonienergia:
Dihedraalienergia: Coulombi energia:
RDF
RDF graafikud. Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
RDF graafikud. Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
B-C8 (anioon-Teflon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-C8.png F-F8 (anioon-Teflon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F-F8.png
B-C (anioon-grafiit): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-C.png F-C (anioon-grafiit): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F-C.png
B-N (anioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-NA.png F-H1 (anioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F-H1.png
C8-C (Teflon-grafiit): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-C8-C.png F8-C (Teflon-grafiit): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-F8-C.png
H1-C (katioon-grafiit): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-H1-C.png N-C (katioon-grafiit): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-C.png
H1-F8 (katioon-Teflon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-H1-F8.png N-C8 (katioon-Teflon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-C8.png
C-C (grafiit-grafiit): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-C-C.png C8-C8 (Teflon-Teflon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-C8-C8.png
B-B (anioon-anioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-B.png N-N (katioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-NA.png
N-C1 (katioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-C1.png N-CE (katioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-NA-CE.png
RDF graafikud simulatsiooni lõpust:
B-CW (anioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-CW.png B-CR (anioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-CR.png
B-C1 (anioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-C1.png B-CE (anioon-katioon): File:40A-52C-1T-132E-npt-RDF-B-CE.png
Coordination sphere radii
TODO
MSD
MSD:
MSD Arvutamiseks lõikasin HISTORY faili 1ns pikkusteks juppideks ja arvutasin iga jupi MSD eelmistest sõltumatult.
Diffusion coefficent
TODO
Coordination time evolution plots
Coordination lifetime
Typical clusters
XYZ file
Nurkade jaotus:
C8-C8-C8 (Teflon): C8-C8-C8-C8 dihedraal:
NA-C1-CE: CR-NA-C1-CE dihedraal:
NPT Simulatsioon 40Å boksis 52 lehekesest grafiidist, 2 jupist Teflonist (20 lüli kummaski) ja 132 ioonpaarist EMI+BF4 10 ns jooksul. Teflonit on massi järgi 6%:
koguenergia: Konfiguratsioonienergia:
Dihedraalienergia: Coulombi energia:
MSD:
Nurkade jaotus:
C8-C8-C8 (Teflon): C8-C8-C8-C8 dihedraal:
NA-C1-CE: CR-NA-C1-CE dihedraal:
Difusioonikoefitsendid
Difusioonikoefitsentide arvutamiseks võtsin kolm viimast ühe nanosekundi pikkust MSD-graafikut ja arvutasin keskmise nende keskmiste sirgete osade tõusudest.
BF4 difusioonikoefitsent (arvutatud booriaatomi järgi):
Koos 3% Tefloniga: D=6.473e-9 cm^2/s
Koos 6% Tefloniga: D=8.306e-9 cm^2/s
EMI difusioonikoefitsent (arvutatud lämmastikuaatomite järgi):
Koos 3% Tefloniga: D=3.250e-8 cm^2/s.
Koos 6% Tefloniga: D=4.793e-8 cm^2/s.
Struktuuri kirjeldus
Ioonvedelik täidavad simulatsiooniboksi servast servani. Ioonvedeliku sees on mõned suured enam-vähem ümmargused gradiidi klastrid. Tefloniahel(ad) on ioonvedeliku sees grafiidist eemal. Kõik EMI-BF ioonid moodustavad ühe suure klastri, paardumata ioone pole.
Ioonide koordineerimise eluiga
Koordinatsiooni ajalise evolutsiooni graafikute arvutamisel loeti NA aatomi (EMI-iooni lämmastikuaatom) ümber koordinatsioonisfääri raadiuseks 5.7Å. Iga graafik kujutab ühe BF4-iooni koordineerumist kõikide EMI-ioonide lämmastikuaatomitega.
Iga viienda BF4-iooni graafikul on selgelt näha lahkumine ühe EMI-iooni juurest ja saabumine uue EMI-iooni juurde ilma hiljem tagasi pöördumata.
Näiteid koordineerimise ajalise käigu graafikutest:
XYZ-failid