Elektrood-03-npt: Difference between revisions
mNo edit summary |
mNo edit summary |
||
Line 1: | Line 1: | ||
= System Description = | = System Description = | ||
3% Polymer (1 chain) % EMI-BF4 (132 ion pairs) % Carbon (57 platelets) | 3% Polymer (1 chain) % EMI-BF4 (132 ion pairs) % Carbon (57 platelets) | ||
= Simulation conditions = | = Simulation conditions = | ||
Line 7: | Line 6: | ||
NPT Simulation in a 40Å^3 box. | NPT Simulation in a 40Å^3 box. | ||
No electric field applied. | No electric field applied. | ||
Length: 10ns. | |||
= Simulation statistics = | = Simulation statistics = | ||
koguenergia: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-engcns.png|320px]] | |||
Konfiguratsioonienergia: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-engcfg.png|320px]] | |||
Sidemeenergia: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-engbnd.png|320px]] | |||
Nurgaenergia: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-engang.png|320px]] | |||
Dihedraalienergia: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-engdih.png|320px]] | |||
Coulombi energia: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-engcpe.png|320px]] | |||
Temperatuur: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-temp.png|320px]] | |||
Ruumala: | |||
[[Image:40A-57C-1T-132E-npt-volume.png|320px]] | |||
= RDF = | = RDF = | ||
Line 105: | Line 126: | ||
== XYZ file == | == XYZ file == | ||
Revision as of 11:59, 3 May 2009
System Description
3% Polymer (1 chain) % EMI-BF4 (132 ion pairs) % Carbon (57 platelets)
Simulation conditions
NPT Simulation in a 40Å^3 box. No electric field applied. Length: 10ns.
Simulation statistics
koguenergia: Konfiguratsioonienergia:
Dihedraalienergia: Coulombi energia:
RDF
RDF graafikud. Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
B-C8 (anioon-Teflon): F-F8 (anioon-Teflon):
B-C (anioon-grafiit): F-C (anioon-grafiit):
B-N (anioon-katioon): F-H1 (anioon-katioon):
C8-C (Teflon-grafiit): F8-C (Teflon-grafiit):
H1-C (katioon-grafiit): N-C (katioon-grafiit):
H1-F8 (katioon-Teflon): N-C8 (katioon-Teflon):
C-C (grafiit-grafiit): C8-C8 (Teflon-Teflon):
B-B (anioon-anioon): N-N (katioon-katioon):
N-C1 (katioon-katioon): N-CE (katioon-katioon):
RDF graafikud simulatsiooni lõpust:
B-CW (anioon-katioon): B-CR (anioon-katioon):
B-C1 (anioon-katioon): B-CE (anioon-katioon):
Coordination sphere radii
TODO
MSD
MSD:
MSD Arvutamiseks lõikasin HISTORY faili 1ns pikkusteks juppideks ja arvutasin iga jupi MSD eelmistest sõltumatult.
Diffusion coefficent
TODO
Coordination time evolution plots
Coordination lifetime
Typical clusters
XYZ file
Nurkade jaotus:
C8-C8-C8 (Teflon): C8-C8-C8-C8 dihedraal:
NA-C1-CE: CR-NA-C1-CE dihedraal:
NPT Simulatsioon 40Å boksis 52 lehekesest grafiidist, 2 jupist Teflonist (20 lüli kummaski) ja 132 ioonpaarist EMI+BF4 10 ns jooksul. Teflonit on massi järgi 6%:
koguenergia: Konfiguratsioonienergia:
Dihedraalienergia: Coulombi energia:
RDF graafikud.
Graafikud järjekorras alt üles kujutavad ajahetki simulatsiooni jooksul 0.5 ns sammuga.
B-C8 (anioon-Teflon): F-F8 (anioon-Teflon):
B-C (anioon-grafiit): F-C (anioon-grafiit):
B-N (anioon-katioon): F-H1 (anioon-katioon):
C8-C (Teflon-grafiit): F8-C (Teflon-grafiit):
H1-C (katioon-grafiit): N-C (katioon-grafiit):
H1-F8 (katioon-Teflon): N-C8 (katioon-Teflon):
C-C (grafiit-grafiit): C8-C8 (Teflon-Teflon):
B-B (anioon-anioon): N-N (katioon-katioon):
N-C1 (katioon-katioon): N-CE (katioon-katioon):
RDF graafikud simulatsiooni lõpust:
B-CW (anioon-katioon): B-CR (anioon-katioon):
B-C1 (anioon-katioon): B-CE (anioon-katioon):
MSD:
Nurkade jaotus:
C8-C8-C8 (Teflon): C8-C8-C8-C8 dihedraal:
NA-C1-CE: CR-NA-C1-CE dihedraal:
Difusioonikoefitsendid
Difusioonikoefitsentide arvutamiseks võtsin kolm viimast ühe nanosekundi pikkust MSD-graafikut ja arvutasin keskmise nende keskmiste sirgete osade tõusudest.
BF4 difusioonikoefitsent (arvutatud booriaatomi järgi):
Koos 3% Tefloniga: D=6.473e-9 cm^2/s
Koos 6% Tefloniga: D=8.306e-9 cm^2/s
EMI difusioonikoefitsent (arvutatud lämmastikuaatomite järgi):
Koos 3% Tefloniga: D=3.250e-8 cm^2/s.
Koos 6% Tefloniga: D=4.793e-8 cm^2/s.
Struktuuri kirjeldus
Ioonvedelik täidavad simulatsiooniboksi servast servani. Ioonvedeliku sees on mõned suured enam-vähem ümmargused gradiidi klastrid. Tefloniahel(ad) on ioonvedeliku sees grafiidist eemal. Kõik EMI-BF ioonid moodustavad ühe suure klastri, paardumata ioone pole.
Ioonide koordineerimise eluiga
Koordinatsiooni ajalise evolutsiooni graafikute arvutamisel loeti NA aatomi (EMI-iooni lämmastikuaatom) ümber koordinatsioonisfääri raadiuseks 5.7Å. Iga graafik kujutab ühe BF4-iooni koordineerumist kõikide EMI-ioonide lämmastikuaatomitega.
Iga viienda BF4-iooni graafikul on selgelt näha lahkumine ühe EMI-iooni juurest ja saabumine uue EMI-iooni juurde ilma hiljem tagasi pöördumata.
Näiteid koordineerimise ajalise käigu graafikutest:
XYZ-failid